用于蛋白质工程的系综最优化方法

蛋白质工程界很需要优秀与实用的蛋白质分子设计系统。本工作经三年努力为此取得了成功。它的理化背景是异型自洽系综最优法，与传统方不同，不在构象空间上而在系综空间上实行优化过程，因而可逃逸局部能量陷阱。跟流行的分子设计多拷贝主法相比，它可平行地实现既能构象空间搜索又能序列空间筛选，从而大大降低计算复杂性和弱化药效假设。经蛋白质表面与核心突变体的结构预测，蛋白质核心设计的序列组合文库筛选，蛋白质活性位点的嫁接以及蛋白质分子柔性对接等的改核，表明此蛋白质分子设计系统是可行的、有效的和优越的。该系统可用于蛋白质工程和药物设计的诸多领域。