真菌侵染线虫蛋白酶的结构与功能研究

以本实验室克隆的真菌侵染、降解线虫的各种蛋白酶为研究对象，采用同源模建方法构建它们的蛋白质三维结构坐标。利用生物信息学计算手段，预测该类蛋白质的物理化学性质、底物结合区域和催化活性位点。进一步，在构建酶与底物或底物类似物复合物结构模型的基础上，利用动力学模拟手段和本质动力学分析方法，分析底物结合区域的几何特征、构象柔性、分子表面电势、以及酶与底物的相互作用能量和动力学特征，以期建立关键结构区域和关键氨基酸与酶催化活性的关系。最后，结合定点突变和酶动力学参数测定等生物化学实验手段，阐明相关侵染酶的结构动力学与催化效率、底物特异性和侵染能力的关系。为构建高效杀线虫工程菌株奠定基础。