谷子抗锈基因Rusi1的精细定位

谷子是我国古老的传统作物，抗旱耐瘠、粮草兼用、营养丰富，发展前景无限广阔。但是，谷子锈病是谷子生产上最为严重的病害之一，利用抗锈品种是最经济有效地防治方法。为了尽快培育抗锈品种，发掘和利用抗锈基因意义重大。课题组利用谷锈菌强毒性小种鉴定出抗源十里香为全生育期抗锈资源，并从其不同杂交组合中选育出了系列抗锈新品系。拟开展的研究项目是在已有的工作基础上，利用谷子高抗抗源十里香及其杂交后代F2分离群体为材料，采用AFLP、SSR、SNP和InDel等多种分子标记技术结合BSA法筛选与抗锈基因Rusi1紧密连锁的分子标记，建立一个高密度的遗传连锁图谱，一方面，为图位法克隆抗锈基因奠定基础，另一方面，将分子标记转化为更稳定的SCAR标记，用于分子标记辅助选择育种，加快抗锈新品种的选育进程。

谷子锈病是谷子生产上的主要病害，利用抗锈品种是经济有效地防治方法。为了尽快培育抗锈品种，发掘和利用抗锈基因意义重大。谷子十里香为全生育期抗锈资源，我们以抗亲十里香、感亲豫谷1号及其杂交后代F2分离群体为实验材料，采用多种分子标记技术将十里香中的抗锈基因精细定位。主要研究结果是：首先，利用分离群体分组分析法（Bulked Segregation Analysis，BSA），采用传统AFLP标记技术和现代简化基因组深度测序技术相结合的创新策略对十里香中抗锈基因Rusi1快速、准确定位到scaffold_8的0.53 M范围内。之后利用定位区间内丰富的SNP标记和可用的SV标记，采用质谱基因分型技术、电泳和测序等方法对F2代感病单株进行了检测，最终将抗锈基因定位在76 kb的关联区域内，建立了高密度的遗传连锁图谱，为图位法克隆抗锈基因Rusi1奠定坚实基础，加速分子标记辅助选择抗锈育种进程。