鲿科鱼类系统演化与历史生物地理学研究

There are over 30 000 fish species worldwide, accounting for more than half of the vertebrate species, which plays an important role in the marine and freshwater ecosystems, thus the study on the diversity and evolution of fishes is an essential component of the animal systematics and evolutionary research. In the present project, bagrid catfishes (Teleostei: Siluriformes: Bagridae) are employed, covering the majority of genera and species in bagrids, particularly those from Africa, South and Southeast Asia. Based on phylogenomic approach, we aim to provide a reliable hypothesis on the phylogeny of bagrid catfishes with mitochondrial genome and multiple nuclear molecular markers. Another purpose of this project is to investigate the divergence time and evolution history of bagrid catfishes with the molecular clock theory based on their fossil records and the earth's geological history, and then to test the competing hypotheses of "Out of India", "Out of Southeast Asia" or other possible historical biogeographic process.

鱼类的物种数（大于30 000种）占整个脊椎动物物种数的一半以上，鱼类也是海洋和淡水生态系统的重要组成部分，因而鱼类的多样性与演化研究是动物系统学与演化研究的重要组成部分。本项目以鲇形目鲿科鱼类为主要研究对象，涵盖鲿科鱼类的多数属种，尤其是非洲、南亚和东南亚的属种，采用线粒体基因组联合多个核基因分子标记分析的系统发育基因组学分析方法来获得一个鲿科鱼类可靠的系统发育关系假说。在此基础上，结合鲿科鱼类化石记录和地球地质历史，运用分子钟理论和分析方法，推算鲿科鱼类起源演化时间，借以探讨鲿科鱼类的起源演化历史，并检验“走出印度”、“走出东南亚”假说或者其他可能的历史生物地理学过程。

鲇形目鲿科鱼类广泛分布于亚洲和非洲，其历史生物地理学过程是检验“走出印度”或“走出东南亚”假说的理想模型。本项目以鲿科鱼类为主要研究对象，基于14属、84种鲿科鱼类样品，采用高通量测序技术，运用系统发育基因组学分析方法，结合鲿科及相关类群鱼类的化石记录，探讨了鲿科鱼类的系统发育关系及其起源演化历史。目前的研究进展表明，鲿科鱼类并非单系类群，其于渐新世时期起源于南亚地区，如现今的印度、孟加拉国等地，结合地球地质事件，鲿科鱼类的多样性演化与青藏高原的演化密切相关。