基因IV型戊型肝炎病毒的分子起源及流行预测研究

我国人群戊肝病例逐年上升，基因IV型戊肝病毒（HEV）是主导的流行株并以猪为宿主。类似SARS、禽流感等人畜共患病，猪等动物的介入加快HEV的进化。为揭示HEV的进化、起源及流行预测，本研究在急性戊肝临床流行病学和成年商品猪HEV携带率的基础上，获取我国人、猪IV型HEV RdRp基因序列。以Bayesian统计框架和MCMC算法为基础，围绕HEV RdRp进化分析的基本参数及重组和适应性选择位点的存在情况，进行复杂进化分析模型的优选，并整合松散分子钟假设，以实现进化推断及核苷酸替换的共估计；拟合Bayesian Skyline等模型，估计人、猪群HEV分子进化率，推算进化起源时间和病毒种群的演化历史及进化事件，并估算HEV感染有效人数的时间动态趋势。在此基础上评估猪群携带HEV对人群戊肝流行的影响，为HEV预警提供科学依据。