用比较基因组方法从进化角度研究基因选择性剪接变化规律及功能联系

选择性剪接是真核生物的一种重要的精细调节基因表达与功能、形成多样化蛋白产物的机制。对其进行跨物种、基因组水平的比较分析不仅可以帮助深入探寻选择性剪接内在机理与变化规律，而且对于了解基因功能进化及人类相关疾病诊断治疗具有非常重要的意义。本研究拟通过大范围选择多物种共有的直系同源基因作为目标基因，收集多种真核生物物种（尤其是高等真核生物）基因组、EST及mRNA序列作为数据基础，采用生物信息学手段预测各真核物种目标基因的选择性剪接方式并形成数据库。同时比较不同的检测手段，探索优化出高效的不同物种选择性剪接产物的实验验证方法。采用此方法并配合已有的相关研究报道对重要基因的预测结果进行验证，结合它们在各物种中不同剪接产物的序列特征和功能差异，设计合适的分析模型，归纳出其内在变化规律及其与基因产物多样性、功能精细调控的关系。最终对物种内与物种间的选择性剪接规律和功能相关性进行深入剖析。