红皮云杉谱系地理学及其第四纪冰期避难所研究

基本信息
批准号:31500540
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:20.00
负责人:贾子瑞
学科分类:
依托单位:中国林业科学研究院林业研究所
批准年份:2015
结题年份:2018
起止时间:2016-01-01 - 2018-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:王军辉,王福德,杨桂娟,翁海龙,王鑫,夏燕,苗晓娟
关键词:
遗传结构分子标记地理分布遗传距离基因流
结项摘要

In this study, using 2b-rad technology 180 individuals from 12 natural populations in Picea koraiensis will be detected to reveal its genetic structure and phylogeography. Sequencing data will be aligned to the genome by the SOAP2 software, and be classified using the method of maximum likelihood (ML) . then cluster analysis of data, phylogenetic analysis, Partitioned RAD analyses and Estimating homology to coding regions will be implemented. According to the above statistics and analysis it will infer to population genetic structure, the glacial refugia and post glacial migration route in Picea koraiensis .

本研究应用2b-rad技术研究红皮云杉天然分布区的12个群体,每群体15个体的群体遗传结构和谱系地理学。研究应用利用SOAP2软件将测序数据比对到基因组中后,利用极大似然法(ML)进行位点的分型;然后对数据进行聚类分析、系统进化分析、分区是rad分析和估计同源的编码区,根据以上统计分析解释红皮云杉群体遗传结构、冰期避难所,以及冰期后迁移路线。

项目摘要

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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