新疆地区草食家畜毕氏肠微孢子虫群体遗传结构研究

Entervcytozoon bieneusi is an important zoonotic pathogen, usually transmitted via food and water. Nearly 300 genotypes of E. bieneusi have been described, which appeared to genetic diversity, host adaptation and geographical segregation. The geographical environment and ecological environment of Xinjiang Uyghur Autonomous Region are rich and varied. Our previous studies found that the genotypes distributions of E. bieneusi from cattle, horse and Bactrian camels in Xinjiang were different from those of other areas. It was unclear whether host adaptation and geographical segregation of E. bieneusi in other herbivorous livestock in Xinjiang. To better understand the genetic variation and genotypes distributions of E. bieneusi, the present study will determine the prevalence and identify genotypes of E. bieneusi in herbivorous livestock in Xinjiang by molecular detection. Based on the MLST data, the population genetic structure of E. bieneusi genotypes will be calculated. The present project will focus on understanding the transmission dynamics and mechanism of zoonotic of E. bieneusi in different host. The data should be uesful in the monitoring and traceability of E. bieneusi.

毕氏肠微孢子虫是一种重要的人兽共患病原，主要经食源和水源性传播。目前已鉴定出近300个基因型，呈现遗传多样性、宿主适应性和地理隔离分化特征。新疆地区地理环境和生态环境丰富多样，申请人课题组前期研究发现，该地区牛、马和双峰驼的毕氏肠微孢子虫基因型流行分布与国内外其他报道存在差异，该地区其他草食家畜是否也存在宿主适应性和地理隔离分化特征尚不清楚。本项目拟基于ITS基因位点对新疆地区草食家畜开展毕氏肠微孢子虫分子流行病学调查，掌握其遗传变异规律和地域分布特征，采用MLST分型方法对毕氏肠微孢子虫分离株进行群体遗传结构研究，解析其在不同宿主间的传播动力及人兽共患机制。项目的开展和完成将为毕氏肠微孢子虫病的监测和溯源提供基础数据和资料。

毕氏肠微孢子虫是常见人兽共患肠道病原之一，主要通过水源和食源传播，具有重要的公共卫生意义，其基因型存在遗传多样性/宿主特异性和地理隔离分化特征。本项目采用PCR法检测新疆部分地区牛、羊、马、驴、鹿、羊驼等草食家畜毕氏肠微孢子虫感染情况，发现不同宿主感染的毕氏肠微孢子虫基因型呈现遗传多样分布特点，共鉴定出30多种基因型；其中奶牛以宿主特异性基因型J为优势感染基因型，绵羊以宿主特异性基因型BEB6为优势感染基因型，马属动物以宿主特异性基因型horse1为优势感染基因型，塔里木马鹿以宿主特异性基因型BEB6为优势感染基因型，羊驼以宿主特异性基因型ALP3为优势感染基因型，提示毕氏肠微孢子虫具有宿主适应性遗传特征。.开展新生犊牛毕氏肠微孢子虫季节动态流行规律调查，发现新生犊牛毕氏肠微孢子虫感染率较低，无明显季节性感染；某场25头新生犊牛1-10周龄粪便样本中，以6周龄犊牛感染率最高，为92.0%(23/25)，1和2周龄犊牛未发现感染。各周龄犊牛毕氏肠微孢子虫均以基因型J为优势感染基因型，基因型改变主要在犊牛的3、5、9和10周龄。.对80株新疆南疆绵羊源毕氏肠微孢子虫基因型BEB6阳性样品进行MLST分型，在MS1基因序列存在12个基因亚型，在MS7基因序列存在3个基因亚型；对81株新疆南疆塔里木马鹿源毕氏肠微孢子虫基因型BEB6阳性样品进行MLST分型，在MS1位点存在12个基因亚型；在MS3位点存在4个亚型；在MS7存在7个亚型，有10个样本在3个位点同时形成序列亚型，共构成10个MLGs。研究结果提供了草食家畜源毕氏肠微孢子虫宿主适应性进化基础数据。