关于化学与生物信息学的网络分布式计算共享平台研究

基本信息
批准号:21375090
项目类别:面上项目
资助金额:80.00
负责人:李梦龙
学科分类:
依托单位:四川大学
批准年份:2013
结题年份:2017
起止时间:2014-01-01 - 2017-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:文志宁,李益洲,敬闰宇,罗杰斯,汪洋旭,匡启帆,伍一鸣,华勇攀,胥欣
关键词:
资源共享化学计量学分布式计算化学与生物信息学
结项摘要

With the rapid development of modern testing technology and the finishment of the Human Genome Project, the relevant data, resources, and information increase explosively in many fields such as proteomics, genomics, and chemogenomics and so on. Studies of Chemo- and Bioinformatics become more and more complicated due to the diversity and abundance of data. It's therefore desirable to design efficient algorithms for integrating various data for systematic analysis. Distributed computing,as a powerful and easy expanding method,was rarely reported for Chemo- and Bioinformatics studies. So, in this project, we attempt to develop a distributed computing and sharing platform for Chemo- and Bioinformatics. Algorithms for data integrating will firstly be studied and then databases will be constructed for different kinds of dataset. On basis of these work, studies will be carried on distributed parallel computing algorithms as the key task in this project. Finally, a platform of distributed computing system will be shared online via a designed interactive system. The performance of our studies will facilitate resource sharing, and improving the research efficiency.

随着现代测试技术的发展,尤其是自人类基因组计划完成和各种人类后基因组计划的实施,各种生物类分子,相关数据和资源都呈爆炸性地增长。化学和生物信息学领域呈现数据多样化、数据量庞大和计算复杂度高等特点。如何提高计算效率,实现数据的系统化整合分析已经成为该领域重要研究内容。分布式计算具有高效,易扩展等特征,但是专门针对化学与生物信息学研究的分布式计算平台鲜见于报道。本项目拟针对化学和生物信息学设计和发展基于网络共享的分布式计算平台。开展关于各类数据整合算法的研究和数据库构建;针对不同数据特点研究设计并行算法;最后,基于用户友好的交互系统实现平台数据和算法的有效共享。该项目的开展将有助于实现国内相关领域资源的优势互补,提高研究工作效率,具有较好的实用价值。

项目摘要

随着现代测试技术的发展,尤其是自人类基因组计划完成和各种人类后基因组 计划的实施,各种生物类分子,相关数据和资源都呈爆炸性地增长。化学和生物信息学领域 呈现数据多样化、数据量庞大和计算复杂度高等特点。如何提高计算效率,实现数据的系统 化整合分析已经成为该领域重要研究内容。分布式计算具有高效,易扩展等特征,但是专门 针对化学与生物信息学研究的分布式计算平台鲜见于报道。本项目拟针对化学和生物信息学 设计和发展基于网络共享的分布式计算平台。开展关于各类数据整合算法的研究和数据库构 建;针对不同数据特点研究设计并行算法;最后,基于用户友好的交互系统实现平台数据和 算法的有效共享。该项目的开展将有助于实现国内相关领域资源的优势互补,提高研究工作 效率,具有较好的实用价值。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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