基于metagenetics技术建立快速高效的生物多样性监测法

生物多样性测量在解决我国环境问题的工作中受到了越来越多的关注，如对具有丰富及特有生物多样性的地区进行调查及监测、病虫害及环境污染的监控、生态保护项目（如人工橡胶林种植）的管理与监督等。然而目前的生物多样性测量既耗时又费钱。因此，本项目拟将metagenetics与二代测序技术、生物信息学和统计学分析相结合，缩短生物多样性调查与监测的周期。我们把metagenetics技术运用到动物条形码（线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ基因-COI）的研究中，主要进行以下工作：（1）改进COI引物的通用性，增加目标类群扩增过程中的物种获得率；（2）建立一套用于metagenetics数据的生物信息学分析系统；（3）基于生物信息学分析系统的结果，建立环境监测和自然保护的数学模型；（4）并与传统方法采集的生物多样性数据进行比较。该监测法的成功建立将对自然保护、害虫诊断、污染水平检测及建立绿色经济等具有重要的意义。

生物多样性评估对于我国环境的管理及政策制定意义重大，但是目前的生物多样性评估方法既耗时又费钱，还须依赖分类学专家进行物种鉴定，因此，本项目将基因组与二代测序技术、生物信息学及统计学分析相结合，缩短了生物多样性调查与检测的周期，能更有效、更快速、更省钱地进行环境评估工作。我们把宏基因组技术运用到动物条形码的研究中，主要进行了以下工作：（1）改进了COI 引物的通用性，增加目标类群扩增过程中的物种获得率；（2）建立了一套用于高通量条形码数据的生物信息学分析系统；（3）基于生物信息学分析系统的结果，建立环境监测和自然保护的数学模型；（4）并与传统方法采集的生物多样性数据进行比较。本项目的成果对自然保护、害虫诊断、污染水平检测及建立绿色经济等具有重要的意义。. 本项目旨在发展一项高通量条形码技术并利用该技术进行实地检验和进一步发展线粒体宏基因组技术。本项目共分为4个目标：1、引物开发；2、实验方法和生物信息途径；3、统计分析；4、实地检验。我们已完成了本项目的全部目标，并发表了相应的文章。