可变剪接网络构建与分析研究

Alternative splicing of mRNA is a highly regulated process that generates the proteome diversity and plays an important role in cellular differentiation and disease. Advances in high-throughput sequencing technology in the past decade have created the unprecedented ability to explore alternative splicing in genome-wide manners. However, understanding the complex and dynamic nature of alternative splicing remains a difficult and, until recently, a much overlooked task. In this project, we explicitly attempt to detangle the coordination mechanism between splicing regulation elements by constructing heterogeneous alternative splicing regulatory network. Moreover, we attempt to identify mixture splicing modules and detect combinatorial co-regulatory motifs in alternative splicing network. Also, we attempt to discover the relationship between alternative splicing and cancers. This project will provide a more comprehensive view of cooperation mechanism between the splicing elements, bring us to a fuller understanding of a RNA splicing mechanism and thus to a more sustainable and healthier future.

可变剪接是基因转录后调控的重要途径，在基因表达、蛋白质合成以及代谢调节等方面发挥着重要作用，RNA的可变剪接异常与众多人类疾病的发生具有密切联系。随着高通量测序技术的发展生成了越来越多可利用的测序数据，使得系统性研究揭示RNA调控修饰的内在机理成为了可能。本项目拟针对RNA可变剪接复杂性、动态性等特征，从全局角度研究RNA可变剪接元件间的协作机制，提出有效的、合理的、能够反映真实生命过程的分析、挖掘方法，在此基础上研究一些癌症病变的机理。主要包括：（1）可变剪接相关生物元件之间调控关系的研究；（2）可变剪接相关生物元件间相互作用的动态机制研究；（3）可变剪接与癌症相关研究。本项目的研究能够系统地了解剪接元件之间的协作机制，对剪接机制提供全新的理解。

可变剪接是基因转录后调控的重要途径, 在基因表达、蛋白质合成以及代谢调节等方面发挥着重要作用，RNA的可变剪接异常与众多人类疾病的发生具有密切联系。随着高通量测序技术的发展生成了越来越多可利用的测序数据，使得系统性研究揭示RNA调控修饰的内在机理成为了可能。本项目拟针对RNA可变剪接复杂性、动态性等特征，从全局角度研究RNA可变剪接元件间的协作机制，提出有效的、合理的、能够反映真实生命过程的分析、挖掘方法，在此基础上研究一些癌症病变的机理。主要包括：（1）可变剪接相关生物元件之间调控关系的研究；（2）可变剪接相关生物元件间相互作用的动态机制研究；（3）可变剪接与癌症相关研究。本项目的研究能够系统地了解剪接元件之间的协作机制，对剪接机制提供全新的理解。