栉孔扇贝细胞遗传学图谱构建

细胞遗传学图反映DNA标记或基因在染色体上实际的物理位置，揭示基因与分子标记间的真实连锁关系，为基因工程育种提供理论依据。本研究结合栉孔扇贝已有的基因组学研究基础，应用荧光原位杂交技术(FISH)，从四个方面开展细胞遗传学图构建工作: a.筛选包含转座子、卫星、小卫星等重复序列的Fosmid克隆，将这些重复序列定位到染色体上，分析栉孔扇贝基因组中重复序列在染色体上的分布特征；b.将遗传连锁图谱上的SSR标记定位到染色体上，为栉孔扇贝遗传连锁图谱与物理图谱的整合奠定基础；c.将与生长、抗逆相关的功能基因定位到染色体上，为研究基因网络提供细胞遗传学证据；d.绘制栉孔扇贝细胞遗传学图谱，实现栉孔扇贝单条染色体的识别鉴定。研究结果将丰富扇贝细胞遗传学研究内容，有助于了解功能基因、分子标记、重复序列的连锁关系及进一步的遗传育种应用。

细胞遗传学图反映DNA标记或基因在染色体上实际的物理位置，揭示基因与分子标记间的真实连锁关系，为基因工程育种提供理论依据。经过3年的研究工作，课题组取得以下重要成果:1) 建立了贝类多色多重荧光原位杂交技术（M-FISH），绘制出第一张栉孔扇贝细胞遗传学图谱，图谱共包含61个位点，包括5个功能基因、32个SSR标记、8个重复序列以及16个包含未知序列的BAC克隆，实现了栉孔扇贝19条染色体的区分鉴定; 2) 将遗传连锁图谱上的SSR标记（包含与重要经济性状相关的QTL）64个标记进行染色体定位，有40个位点成功定位到栉孔扇贝的染色体上，实现了遗传连锁图谱与细胞学图谱的初步整合，定位结果显示SSR标记在染色体的位置与其在连锁图上的位置存在一定的偏差，研究结果遗传图谱与物理图谱的整合提供了依据;3) 将包含重复序列的28个fosmid克隆进行染色体定位，发现栉孔扇贝重复序列主要分布于染色体的端部位置，其次是着丝粒位置，少数定位在染色体臂的中间位置；4)定位了16个包含生长、发育、抗逆相关功能基因的Fosmid、BAC克隆，获得了这些基因在染色体上的位置。研究结果为扇贝基因组学、基因网络以及进化研究提供了重要依据。