养心通脉有效部位方对BMSCs作用靶点及信号转导通路的研究

基本信息
批准号:81102595
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:22.00
负责人:郑景辉
学科分类:
依托单位:湖南中医药大学
批准年份:2011
结题年份:2014
起止时间:2012-01-01 - 2014-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:瞿岳云,刘吉勇,吴新正,曾刚,王丽萍
关键词:
蛋白质组学信号转导通路骨髓间充质干细胞药物靶点养心通脉有效部位方
结项摘要

骨髓间充质干细胞(BMSCs)治疗缺血性心脏病,存在诱导分化、存活及归巢心肌组织百分率低,向非目的细胞的转化甚至癌变等问题亟待解决。本项目组前期工作发现养心通脉有效部位方(apr-YTF)对心肌缺血大鼠的BMSCs具有体外诱导向心肌分化、移植归巢于心肌组织、动员外周血CD34-细胞数增多的作用。本项目拟运用免疫蛋白组学方法揭示apr-YTF对BMSCs膜蛋白作用靶点、磷酸化蛋白组学方法发现apr-YTF对BMSCs酪氨酸磷酸化蛋白,然后用生物信息学方法,挖掘出其达差异和关联的细胞膜蛋白和磷酸化酪氨酸蛋,再采用Pathway Studio 5.0软件建立已鉴定蛋白的信号通路网络并进行免疫共沉淀(Co-IP)和Western-blotting验证。本项目从系统生物学水平揭示apr-YTF对BMSCs膜蛋白作用靶点及其信号转导通路,为从系统、整体水平解释中医药"多因、多效、多靶点"机制奠定基础。

项目摘要

为了探讨养心通脉有效部位方(apr-YTF)对体外培养骨髓间充质干细胞(BMSCs)膜蛋白作用靶点及信号转导通路开展研究。(1)采用核素标记相对和绝对定量(iTRAQ)、TOF/TOF串联质谱分析结合SWISSPROT数据库进行检索鉴定蛋白的方法对apr-YTF对体外培养BMSCs膜蛋白免疫蛋白质组学进行了研究,质谱分析结果显示在apr-YTF组和阴性对照组筛选和鉴定出236个蛋白,满足peptides>2,Pval<0.05,115∶113>1.2和115∶113<0.8条件的蛋白有62个,其中表达上调的有48个,表达下调的有14个。(2)采用2D-DIGE、TOF/TOF串联质谱分析结合SWISSPROT数据库进行检索鉴定蛋白的方法对apr-YTF对体外培养BMSCs磷酸化蛋白质组学进行了分析,结果发现上调磷酸化蛋白4个。(3)根据apr-YTF对BMSCs作用差异蛋白,通过DAVID数据库搜索软件结合 GO数据库搜索,进行注释和富集度分析,KEGG数据库进行信号转导通路分析,VISANT、String数据库检索蛋白质相互作用,MetPA和HMDB数据库对其代谢产物网络途径进行分析。结果发现差异蛋白主要参与102种生物学过程、35种细胞组分、6种分子途径,差异蛋白主要参与3条信号转导通路,这些蛋白在3条信号转导通路上相互发生作用。处于差异蛋白功能交互网中交叉点位置的Presenilin-1、Presenilin-2通过Notch 信号通路,Syntaxin-4蛋白通过可溶性N-乙基顺丁烯二酰亚胺敏感性的融合蛋白附着蛋白(SNARE)信号通路,丝裂原活化蛋白激酶12(MAPK 12)通过MAPK信号通路在apr-YTF诱导BMSCs向心肌分化过程中发挥作用。(4)根据生物信息学的预测,对研究中MAPK、Notch通路进行了生物验证,结果JNK信号通路参与apr-YTF导BMSCs心肌定向分化过程。结论认为apr-YTF对BMSCs的作用是在多位点、多环节、多种生物学进程中发挥作用,蛋白质组学生物信息学技术可以站在“整体观”的角度对中医药的作用机制作出预测,结合分子生物学验证是一条很好的中医药现代化途径。.项目按计划完成,已发表相关论文8篇,其中SCI收录2篇,录用未发表6篇。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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