基于定量蛋白质组学研究建立口腔癌预测淋巴结转移暨预后的新型分子标记诊断法

随着人类基因组计划的实施和推进，生命科学研究已经进入后基因时代。一个基因对应着数个或数十个蛋白质，因此基因与蛋白质之间没有线形对应关系。总而言之，蛋白质更能直接地反应机体的生理和病理状态。近年来，蛋白质组学的发展为生命科学领域打开了崭新的一页，在医学领域中更为突出。临床蛋白质组学的目标是改进疾病的分子分类，为诊断、治疗和预防提供更为敏感的标记分子。口腔癌是头颈部常见的恶性肿瘤，有较高的淋巴结转移率。本研究采用口腔癌FFPE（福尔马林固定石蜡包埋）组织，以2DICAL（2-diamensional image-converted analysis of liquid chromatography and mass spectrometry）方法，对口腔癌进行定量蛋白质组学解析，研发预测淋巴结转移暨预后的新型分子标记诊断法。

口腔鳞状细胞癌是头颈部常见的恶性肿瘤，且有较高的淋巴结转移率，探索其敏感分子标记物是当今研究的热点。虽然基因表达分析与口腔癌相关研究已经获得显著的成绩，但目前还没有寻独特敏感的相关标记物引用于临床工作。基因表达往往与蛋白质表达量不能正相关，因此蛋白质表达更能够直接地反应机体的生理和病理状态。近年来，蛋白质组学的发展为生命科学许多研究领域打开了新的一页，在医学领域中更突出。临床蛋白质组学的目标是改进疾病的分子分类，为疾病的诊断、治疗和预防提供更为敏感的标记因子。本研究选择口腔鳞状细胞癌新鲜组织标本，分为淋巴结转移阳性和阴性组，采用双向凝胶电泳技术（two-dimensional gel electrophoresis，2-DE）分离两组的差异蛋白点，基质辅助激光解吸电离串联飞行时间质谱（MALDI-TOF-TOF MS）鉴定差异蛋白。研发预测口腔癌淋巴结转移与预后的新型分子标记诊断系统。将口腔鳞状细胞癌新鲜组织标本20例，其中淋巴结转移阳性组12例，阴性组8例，采用双向凝胶电泳技术（two-dimensional gel electrophoresis，2-DE）分离两组的差异蛋白点，共获得126个差异蛋白点，进行MALDI-TOF-TOF MS鉴定。通过差异比率、蛋白质通路及蛋白互作等综合分析，筛选42个显著差异表达蛋白质，其中上调蛋白质28个，下调蛋白质14个。这些蛋白质分布于多种通路参与细胞增殖、分化、调亡、转录、粘附、血管形成、蛋白质翻译合成加工修饰等功能。这些差异蛋白质也可以在蛋白质通路以及互作蛋白质关系角度筛选更敏感的蛋白质，制作蛋白质芯片，引用于临床，对口腔癌淋巴结转移的预测具有重要意义。为今后口腔癌淋巴结转移敏感因子的探索，提供新的线索和依据。